根据《建设工程消防设计审查验收管理暂行规定》，当消防设计审查验收主管部门发现消防设计文件不合格时，将采取以下措施：
出具不合格意见：主管部门应当出具消防设计审查不合格意见，并详细说明不合格的原因和依据。
提出整改建议：在不合格意见中，主管部门会提出具体的整改建议，指出需要改进的地方和具体的整改措施。
指导整改：主管部门会与建设单位、设计单位沟通，指导其进行必要的整改，确保设计文件符合国家工程建设消防技术标准。
重新申请审查：建设单位在完成整改后，需要重新提交消防设计审查申请，再次接受主管部门的审查。只有在新的设计文件通过审查后，才能继续施工。
通过这些严格的处理措施，可以确保所有特殊建设工程的消防设计都达到规定的安全标准，从而保障人民群众的生命财产安全。
考试科目：安全生产法律法规
考点：特殊建设工程的审查
考点练习题：
1、根据《建设工程消防设计审查验收管理暂行规定》，关于建设工程消防设计审查验收管理的说法，正确的是（）。
A. 建设单位依法对建设工程消防设计、施工质量负主体责任
B. 国家实行建设工程消防设计审查制度
C. 建设工程消防设计审查抽查比例由设区的市级人民政府住房和城乡建设主管部门确定
D. 实行施工图设计文件联合审查的，建设工程消防设计的技术审查应并入联合审查
选项A错误，第八条建设单位依法对建设工程消防设计、施工质量负首要责任。设计、施工、工程监理、技术服务等单位依法对建设工程消防设计、施工质量负主体责任。建设、设计、施工、工程监理、技术服务等单位的从业人员依法对建设工程消防设计、施工质量承担相应的个人责任。
选项B错误，第十五条;对特殊建设工程实行消防设计审查制度
选项C错误，第三十六条;消防设计审查验收主管部门应当对备案的其他建设工程进行抽查。抽查工作推行“双随机、一公开”制度，随机抽取检查对象，随机选派检查人员。抽取比例由省、自治区、直辖市人民政府住房和城乡建设主管部门，结合辖区内消防设计、施工质量情况确定，并向社会公示。
