也称为政府审计，是国家专门机关对国家重大政策措施贯彻落实情况，公共资金、国有资产、国有资源分配使用的真实合法效益，以及基金责任等所进行的监督活动。
是一种独立、客观的确认和咨询活动，运用规范的程序和方法，审查和评价组织业务活动及其内部控制、风险管理的适当性、合法性和有效性，促进组织改善治理和管理，帮助组织增加价值，实现其目标。
注册会计师依法接受委托，对被审计单位的相关经济活动及其资料进行独立审查并发表审计意见。
区别 | 政府审计 | 注册会计师审计 |
主体 | 政府审计机关（审计署和审计局） | 注册会计师 |
审计目标和对象不同 | 对政府的财政收支或者国有金融机构和企事业单位财务收支进行审计，确定其是否真实、合法和有效 | 注册会计师依法对企业财务报表进行审计，确定其是否符合会计准则和相关会计制度，是否公允反映了财务状况、经营成果和现金流量 |
审计的 标准 | 《中华人民共和国审计法》和审计署制定的国家审计准则 | 《中华人民共和国注册会计师法》和财政部批准发布的注册会计师审计准则 |
经费或收入来源 | 行政行为 列入同级财政预算，由同级人民政府予以保证 | 市场行为、有偿服务 费用由注册会计师和审计客户协商确定 |
取证权限 | 有关单位有责任配合，具备更大的强制力，有关单位和个人应当支持、协助、反馈和提供材料 | 不具备行政强制力，很大程度上依赖于企业及相关单位配合和协助 |
对发现问题的处理方式 | 可在职权范围内作出审计决定或者向有关主管机关提出处理、处罚意见 | 提请企业调整有关数据或进行披露，没有行政强制力；如果企业拒绝调整和披露，注册会计师需根据具体情况予以反映，具体表现为出具保留意见或否定意见的审计报告。 |
1、在审计独立性上
内部审计：内审机构受所在单位的直接领导，独立性受到一定的限制，其独立性只是相对于本单位其他职能部门而言的
注册会计师审计：注册会计师审计是由与被审计单位完全无关的第三方进行的，具有较强的独立性
2、在审计方式上
内部审计:单位根据自身经营管理的需要安排进行的
注册会计师审计:接受委托进行的
3、在审计程序上
内部审计:可以根据所执行业务的目的和需求选择并实施必要的程序
注册会计师审计:需要严格按照执业准则的规定程序进行
4、在审计职责上
内部审计:只对本单位负责，其审计质量基本与外界无直接关系
注册会计师审计:注册会计师审计不仅对被审计单位负责，而且对社会负责，其审计质量对广大财务信息使用者做出相关决策有直接影响
5、在审计作用上
内部审计:作为本单位改善工作的参考，对外不起鉴证作用，并对外保密
注册会计师审计:注册会计师审计结论则要对外公开并起鉴证作用
【例题-单选题】下列有关注册会计师审计和政府审计的共同点的说法中，正确的是（ ）。
A．注册会计师审计和政府审计的取证权限相同
B．注册会计师审计和政府审计都可以对发现的问题提出处理、处罚意见
C．注册会计师审计和政府审计的依据都是《中华人民共和国审计法》
D．注册会计师审计和政府审计都是国家治理体系及治理能力现代化建设的重要方面
注册会计师审计和政府审计共同发挥作用，是国家维护市场经济秩序，强化经济监督的有利手段，两者都是国家治理体系和治理能力现代化建设的重要方面（选项D正确），但也存在以下几方面的区别。
（1）审计目标和对象不同。
（2）审计的标准不同。政府审计的依据是《中华人民共和国审计法》和审计署制定的国家审计准则，注册会计师审计的依据是《中华人民共和国注册会计师法》和财政部批准发布的注册会计师审计准则（选项C错误）。
（3）经费或收入来源不同。
（4）取证权限不同（选项A错误）。
（5）对发现问题的处理方式不同。审计机关对违反国家规定的财政收支、财务收支行为可在职权范围内作出审计决定或者向有关主管机关提出处理、处罚意见。注册会计师对审计过程中发现的问题只能提请企业调整有关数据或进行披露，没有行政强制力（选项B错误）
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