A.发包人被处以罚款
B.施工合同已经履行
C.施工合同因故解除
D.承包人通知发包人将部分工程款交付给第三人
E.施工过程中承包人与发包人合并
参考答案：B,C,E
参考解析：BCE正确：根据《民法典》规定，引起合同权利义务终止的情形包括：(1) 债务已经履行。(2) 债务相互抵销(3) 债务人依法将标的物提存(4) 债权人免除债务 (5) 债权债务同归于一人 (6)法律规定或者当事人约定终止的其他情形。如出现了法律规定的终止的情形，在委托合同中，受托人死亡、丧失民事行为能力的，委托合同终止。合同解除也包含于此种情形之中，合同解除包括法定解除与约定解除。A. 发包人被处以罚款：发包人被处以罚款并不影响施工合同的权利义务，因此不导致合同权利义务终止。D. 承包人通知发包人将部分工程款交付给第三人：这只是付款方式的变化，并不导致合同权利义务终止。
