A.甲施工企业尚未支付运费的，乙运输公司不得要求支付运费
B.该运费由甲施工企业承担
C.乙运输公司已收取运费的，甲施工企业无权要求返还
D.运费由甲施工企业和乙运输公司共同承担
参考答案：A
参考解析：货物在运输过程中因不可抗力灭失，未收取运费的，承运人不得要求支付运费；已收取运费的，托运人可以要求返还。
A.甲施工企业尚未支付运费的，乙运输公司不得要求支付运费
B.该运费由甲施工企业承担
C.乙运输公司已收取运费的，甲施工企业无权要求返还
D.运费由甲施工企业和乙运输公司共同承担
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